國家微生物科學數據中心依托中科院微生物研究所，與中科院海洋所、中國疾控中心傳染病所、中科院植物生理生態所等單位共建。中心數據資源總量超過300TB，數據記錄數超過40億條,數據內容完整覆蓋微生物資源、微生物及交叉技術方法、研究過程及工程、微生物組學、微生物技術以及微生物文獻、專利、專家、成果等微生物研究的全生命周期。中心在微生物領域超過30年的數據匯交工作，數據來源覆蓋國內中國科學院、其他科研院所、高校、企業等百余家單位。該數據平臺還接收了全球46個國家120個單位的數據匯交和全球共享，是全球微生物領域最重要的數據中心。中心建立了完善的數據質量控制體系和多級數據質量標引體系，牽頭申請并正在開發微生物數據領域第一個國際ISO標準，并在此基礎上，開發了自有知識產權的數據管理平臺，目前已經在國內外上百家單位使用。
